Uma mãe no momento da concepção deve ser saudável, assim como durante a gestação. Isso resulta em uma colonização intestinal equilibrada. Quando um bebê nasce por meios naturais, um grande bolus de bactérias colonizadoras provém da ingestão dos organismos intestinais e vaginais da mãe. Após o nascimento, uma criança coloniza rapidamente seu intestino sob a influência do leite materno, que deveria ser dado exclusivamente pelos primeiros quatro meses de vida.
